

چهارده سال پس از سومین برخورد، شینجی ایکاری در دنیایی بیدار میشود که چیزی از آن به یاد نمیآورد. او پیر نشده است. بخش زیادی از زمین ویران شده، NERV از بین رفته و افرادی که زمانی از آنها محافظت میکرد، علیه او شدهاند. شینجی با دوست شدن با کاوورو ناگیسا مرموز، به مبارزه علیه فرشتگان ادامه میدهد و متوجه میشود که این نبرد به هیچ وجه تمام نشده است، حتی زمانی که میتواند علیه متحدان سابقش باشد. مبارزات شخصیتها در میان نبردها علیه فرشتگان و یکدیگر ادامه مییابد و به جایی میرسد که میتواند به ناچار پایان جهان باشد.